dm-tree.console

# contents of OverlayFS upper mount (will be published)
+ tree /home/idc/brc-cvmfs/work/upper
/home/idc/brc-cvmfs/work/upper
├── config
│   ├── all_fasta.loc
│   ├── bowtie2_indices.loc
│   ├── bowtie_indices.loc
│   ├── bwa_mem_index.loc
│   ├── dbkeys.loc
│   ├── hisat2_indexes.loc
│   ├── lastz_seqs.loc
│   ├── rnastar_index2x_versioned.loc
│   ├── tool_data_table_conf.xml
│   └── twobit.loc
└── data
    ├── GCA_000826245.1
    │   ├── bowtie2_index
    │   │   └── GCA_000826245.1
    │   │       ├── Bowtie2_index_data_manager_json.html
    │   │       ├── GCA_000826245.1.1.bt2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.2.bt2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.3.bt2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.4.bt2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa
    │   │       ├── GCA_000826245.1.rev.1.bt2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.rev.2.bt2
    │   │       └── _gx_data_bundle_index.json
    │   ├── bowtie_index
    │   │   ├── Bowtie_index_data_manager_json.html
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.1.ebwt
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.2.ebwt
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.3.ebwt
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.4.ebwt
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.rev.1.ebwt
    │   │   ├── GCA_000826245.1.fa.rev.2.ebwt
    │   │   └── _gx_data_bundle_index.json
    │   ├── bwa_mem_index
    │   │   └── GCA_000826245.1
    │   │       ├── BWA-MEM_index_data_manager_json.html
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa.amb
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa.ann
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa.bwt
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa.pac
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa.sa
    │   │       └── _gx_data_bundle_index.json
    │   ├── hisat2_index
    │   │   └── GCA_000826245.1
    │   │       ├── GCA_000826245.1.1.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.2.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.3.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.4.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.5.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.6.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.7.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.8.ht2
    │   │       ├── GCA_000826245.1.fa
    │   │       ├── HISAT2_index_data_manager_json.html
    │   │       └── _gx_data_bundle_index.json
    │   ├── len
    │   │   └── GCA_000826245.1.len
    │   └── seq
    │       ├── GCA_000826245.1.2bit
    │       └── GCA_000826245.1.fa
    └── rnastar
        └── 2.7.4a
            └── GCA_000826245.1
                └── GCA_000826245.1
                    └── dataset_9a215138-ae72-4380-addd-a5e7bc47dbde_files
                        ├── Genome
                        ├── SA
                        ├── SAindex
                        ├── _gx_data_bundle_index.json
                        ├── chrLength.txt
                        ├── chrName.txt
                        ├── chrNameLength.txt
                        ├── chrStart.txt
                        ├── genomeParameters.txt
                        └── rnastar_index_versioned_data_manager_json.html